doc: update install instructions and warnings

README.md

@@ -11,6 +11,9 @@ Cloner ce dépôts sur votre système (pas de répertoire privilégié).
 git clone https://git.cohabit.fr/cohabit/server_config.git
 cd server_config
 
+# Decrypt secrets
+gpg -d .env.gpg
+
 # Allow execute scripts
 sudo chmod +x ./install.sh
 sudo chmod +x ./deploy.sh
@@ -19,6 +22,14 @@ sudo chmod +x ./deploy.sh
 sudo ./install.sh --all && sudo ./deploy.sh --all
 ```
 
+> [!WARNING]
+>
+> Après avoir executer `deploy.sh` tous les secrets sont écrits en clair dans
+> les fichiers de configs et les scripts.\
+> Ne surtout pas faire de `git commit` ou de `git push`.\
+> Pour retourner à l'état d'origine faire un `git reset --hard HEAD` ou
+> équivalent.
+
 ## Installation
 
 Pour installer les différents services/apps du serveur.